يعتبر السبب الرئيسي وراء تقطع النوم وساعاته أثناء الليل هو تعطل الساعة البيولوجية والتي تكون مسؤولة عن تنظيم الفترات الخاصة باليقظة والراحة.
وهناك مجموعة من الأسباب الطبية وراء هذا التعطل. ومنها:
كثرة التوتّر والتفكير بالفترة ما قبل النوم.
الضغوط والمشاكل اليومية التي تحدث مع الإنسان خلال يومه.